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　　截至目前，全球有超過(guò)500萬(wàn)人對(duì)β冠狀病毒SARS-CoV-2進(jìn)行了檢測(cè)。該病毒感染會(huì)引起COVID-19疾病的發(fā)展，其表現(xiàn)為多種癥狀，包括持續(xù)的干咳，氣短，發(fā)冷，肌肉疼痛，頭痛，味覺(jué)減退或氣味和胃腸道不適。

　　Evosep One高通量蛋白組學(xué)分離系統(tǒng)，近期也開(kāi)始活躍于最新新冠肺炎的蛋白組學(xué)的應(yīng)用場(chǎng)景中。以下兩篇文獻(xiàn)分別報(bào)道了Evosep One參與檢測(cè)細(xì)胞因子IL-6、病毒感染后DIA蛋白質(zhì)組和DIA磷酸化蛋白質(zhì)組的獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。

　　Evosep One在COVID-19中的首次血清蛋白質(zhì)組應(yīng)用

　　盡管促炎性細(xì)胞因子如白細(xì)胞介素IL-6的水平高低與COVID-19疾病的嚴(yán)重程度有關(guān)，但目前關(guān)于IL-6因子水平對(duì)COVID-19患者蛋白質(zhì)組的影響知之甚少。

　　因此，美國(guó)科羅拉多大學(xué)、哥倫比亞大學(xué)和弗吉尼亞大學(xué)的研究者們對(duì)COVID-19患者的血清進(jìn)行了首次蛋白質(zhì)組學(xué)分析。研究者對(duì)33名COVID-19病人(鼻咽拭子核酸檢測(cè)為陽(yáng)性)和16名未患COVID-19病人(鼻咽拭子核酸檢測(cè)2次均為陰性)分別取200 ng血清樣本，將Evosep One搭載timsTOF Pro進(jìn)行血清蛋白質(zhì)組學(xué)研究。

　　研究表明，COVID-19的患者顯示IL-6水平明顯上調(diào)，IL-6因子是COVID-19的生物標(biāo)志物。研究按照循環(huán)IL-6的水平對(duì)疾病進(jìn)行輕重程度的分層，并且發(fā)現(xiàn)一些凝血因子在血清中的水平明顯失調(diào)與IL-6有關(guān)，且伴隨著包括幾種絲氨酸蛋白酶抑制劑(SERPINs)的抗纖溶成分水平的升高。

　　Evosep One在SARS-CoV-2研究中的DIA蛋白質(zhì)組應(yīng)用

　　德國(guó)馬普所生物化學(xué)研究所和慕尼黑工業(yè)大學(xué)的Matthias Mann和Andreas Pichlmair研究團(tuán)隊(duì)研究了緊密相關(guān)的SARS-CoV-2和SARS-CoV兩種病毒，以及SARS-CoV-2病毒對(duì)肺源性人類細(xì)胞系的轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、泛素組和磷酸化蛋白質(zhì)組等多組學(xué)方面的影響。

　　研究者將高通量的Evosep One與Q Exactive HF-X相連，對(duì)被病毒感染后的細(xì)胞樣本進(jìn)行蛋白組學(xué)分析。實(shí)驗(yàn)分別采用44 min/樣本的方法分析DIA蛋白質(zhì)組，21 min/樣本的方法分析磷酸化蛋白質(zhì)組。

　　本研究的意義在于，通過(guò)對(duì)SARS-CoV-2的多組學(xué)研究，可以用于指導(dǎo)新冠肺炎的藥物篩選。研究最后根據(jù)其得到的多組學(xué)結(jié)果測(cè)試了48種藥物，這些藥物可調(diào)節(jié)病毒干擾路徑對(duì)SARS-CoV-2復(fù)制的影響。其中，B-RAF、JAK1/2、MAPK抑制劑在體外感染環(huán)境中能導(dǎo)致病毒生長(zhǎng)顯著增加，而DNA損傷誘導(dǎo)劑、mTOR抑制劑會(huì)導(dǎo)致病毒被抑制。在藥物篩選中Gilteritinib、Ipatasertib、Prinomastat、Marimastat這4種藥物抗病毒作用最顯著。

　　不論是血液樣本還是組織樣本，Evosep One在新冠肺炎中的強(qiáng)力優(yōu)勢(shì)點(diǎn)在于，能夠幫助高通量樣本的檢測(cè)實(shí)現(xiàn)，以及穩(wěn)健的性能體驗(yàn)。

　　參考文獻(xiàn)：

　　[1] Angelo D’Alessandro, et al. Serum proteomicsin COVID-19 patients: Altered coagulation and complement status as a functionof IL-6 level, medRxiv (2020).

　　[2] Alexey Stukalov, et al. Multi-levelproteomics reveals host-perturbation strategies of SARS-CoV-2 and SARS-CoV,bioRxiv (2020).