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浙江大學(xué)一項(xiàng)新研究運(yùn)用microwell-seq技術(shù)繪制了世界上第一張哺乳動物細(xì)胞表達(dá)圖譜——小鼠細(xì)胞表達(dá)圖譜。Microwell-seq技術(shù)是一種便捷、高效、便宜、穩(wěn)定的高通量單細(xì)胞RNA測序技術(shù)，其核心耗材為杭州晶佰生物科技有限公司旗下產(chǎn)品Microwell-Seq 高通量單細(xì)胞RNA測序試劑盒(Microwell-seq High-throughput Single Cell RNA-Seq Kit, Order No. SC-809-001) http://www.igeneseq.com/research_detail/dxbcp/microwell.html。

2018年2月22日國際頂級生物學(xué)期刊《cell》刊登了浙江大學(xué)教授郭國驥團(tuán)隊(duì)的一項(xiàng)新研究成果。該研究運(yùn)用Microwell-Seq 高通量單細(xì)胞RNA測序試劑盒對來自小鼠 51種器官組織的40余萬個細(xì)胞進(jìn)行了系統(tǒng)性的單細(xì)胞RNA測序，數(shù)據(jù)分析后完成了世界上第一張哺乳動物細(xì)胞表達(dá)圖譜——小鼠細(xì)胞表達(dá)圖譜。

Microwell-Seq技術(shù)進(jìn)行單細(xì)胞RNA測序的流程主要包括單細(xì)胞RNA捕獲和測序兩大部分。Microwell-Seq技術(shù)中用瓊脂糖微孔板進(jìn)行單細(xì)胞分離，實(shí)驗(yàn)過程中確保每個微孔中最多有一個細(xì)胞；然后加入帶有特異性標(biāo)簽的磁珠，確保每個微孔中有一個磁珠；接著在微孔中進(jìn)行細(xì)胞裂解，將mRNA捕獲在磁珠上；收集磁珠后進(jìn)行cDNA合成與高通量測序。該技術(shù)確保單個細(xì)胞mRNA都只同一種特異性標(biāo)簽，進(jìn)而真正實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞測序和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析。

與現(xiàn)有的單細(xì)胞分離技術(shù)相比，Microwell-Seq 高通量單細(xì)胞RNA測序試劑盒有顯著的優(yōu)勢。試劑盒配套的瓊脂糖微孔板含有10萬個微孔，單塊微孔板一次能分離5千-1萬個單細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了高通量單細(xì)胞分離。單細(xì)胞分離的關(guān)鍵耗材瓊脂糖微孔板以廉價瓊脂糖為原料，可重復(fù)利用PDMS板為模板制備，極大降低了單細(xì)胞分離成本，可將單細(xì)胞的測序成本降到0.02美元以下，有利于Microwell-Seq技術(shù)的全面推廣應(yīng)用。